臭氧发生器发出的臭氧，它的杀菌能力不受PH值变化和氨的影响杀菌能力比氯大600到3000倍其灭菌和消毒的效果几本都是瞬间产生的，在水中臭氧浓度0.3-2mg/L的时候在0.5-1min内就可以杀死细菌，想达到同样灭菌效果（如使大肠杆菌杀灭率达99%）所需臭氧水药剂量也仅仅是氯的0.0048%。  
臭氧发生器发出的臭氧对酵母和寄生生物等也有活性，它具有着强悍的杀毒功能，比如可以用它去除以下类型的微生物和病毒：

病毒 已经证明臭氧对病毒具有非常强的杀灭性，例如Poloi病毒在臭氧浓度为0.05-0.45mg/L时，2min就会失去活性。 

孢子有孢衣的保护，它比生长态菌的抗臭氧能力高出10-15倍。  

 
真菌 白色念珠菌和青霉属菌能被杀灭。