臭氧发生器产生的臭氧对水中浮游生物和赤潮生物具有有效的杀灭和抑制作用。

    通过实验臭氧对于浮游生物，溶解臭氧浓度 0.5 - 1 ppm 便能破坏藻类原生动物。对于小型软体动物，溶解臭氧浓度为 2.2 ppm 时，处理时间 30 分钟能杀死 98% 的幼虫。在臭氧注入量为 2.2 - 3 ppm 时，能得到 50% 的杀藻结果。
    臭氧对浮游动物的作用。臭氧对水中浮游生物的杀灭作用是一个受多种因素影响的复杂过程。尽管在每次试验中的水质生化条件不同，其数据有较大的差异，但不难看出水中浮游动物对臭氧反应敏感。在一般情况下，臭氧投加量为 2.08 mg ／ l 时，对浮游动物的杀灭率就可达到 95 ％以上。臭氧投加量为 4.17 mg ／ 1 时对浮游动物的杀灭率可达到 100% 。
    臭氧对浮游植物的作用。浮游植物对于臭氧的反应似乎不那么敏感。臭氧投加量为 1.2mg ／ l 时灭藻率为 31 - 36% ，臭氧投加量为 2.08 mg ／ 1 时对藻类的杀灭率可达 50% 以上，当臭氧投加量达 4.17 mg ／ 1 时对藻类的杀灭率为 89 ％左右。
    赤潮是指海洋中的浮游生物爆发性增殖，造成海水变色。由于其生物种群不同可呈现红、褐或灰黑色。赤潮会对近岸海洋生物造成严重危害。据质料报道臭氧可以有效的杀灭赤潮生物，分解赤潮生物毒素。 在山东长岛县砣矶岛附近海域发现赤潮，并应用臭氧对赤潮生物 ( 夜光虫 ) 进行了杀灭试验，经臭氧处理后夜光虫发生粉碎性破裂。 北京山美水美环保高科技有限公司所对渤海湾赤潮生物多甲藻进行了臭氧杀灭试验。多甲藻经臭氧处理 10 分钟。